2004-2015: Η ΣΥΓΧΡΟΝΗ ΕΠΟΧΗ

Το καλοκαίρι του 2003 ο Όμιλος βρέθηκε μπροστά στην μεγαλύτερη διοικητική κρίση της ιστορίας του. Οι άνθρωποι της ομάδας μπάσκετ αποχώρησαν από το προσκήνιο και το κενό που δημιουργήθηκε έφερε το σωματείο ένα βήμα πριν τη διάλυση. Τελικά η λύση βρέθηκε την ύστατη ώρα και ο ΑΟΠΗ συνέχισε την πορεία του. Οι εξελίξεις αυτές έφεραν πολύ πίσω το τμήμα μπάσκετ, που έπρεπε ουσιαστικά να ξεκινήσει από το μηδέν. Για δύο χρόνια ο όμιλος δεν κατέβασε ανδρική ομάδα, αλλά μόνο παιδικοεφηβικά. Αντίθετα στο ποδόσφαιρο, η προδιαγεγραμμένη πορεία του τμήματος δεν διακόπηκε. Με τους Λεκάκη, Κατσαμά και Χάλαρη να συνεχίζουν να στηρίζουν την ομάδα, την περίοδο 2003-04 ο Προφήτης ανέβηκε στη Β' Κατηγορία με περίπατο, έχοντας μια ομάδα που αποτελείτο εξ' ολοκλήρου από δικά του παιδιά (Ράμμος, Περπερίδης, Καραμπογιάς, Λάππας, οι δύο Θωμάκοι, Βέργος, Καρκαβίλας, Κάλφας, Αρκαλάκης, Βενιός κ.α.). Όλοι αυτοί θα αποτελούσαν και τη ραχοκοκαλιά της ομάδας, στα επόμενα χρόνια, όταν και με σταθερά ανοδική πορεία, ο Προφήτης επέστρεψε στην Α' Κατηγορία ακριβώς τριάντα χρόνια μετά από την πρώτη του άνοδο. Η πρώτη χρονιά στη Β' (04-05) ήταν αρκετά δύσκολη και χρειάστηκε το αξέχαστο ματς με τον Πειραϊκό, που τελείωσε 1-1, για να κρατηθεί η ομάδα στην κατηγορία. Την επόμενη χρονιά η πορεία ήταν πολύ καλύτερη (έβδομη θέση) και το 2007 ήταν η μεγάλη ώρα: Με προπονητή τον Αντώνη Καρυτινό, έναν άνθρωπο που αγαπήθηκε παράφορα στο λόφο, τη μαγιά των δικών μας παιδιών (είχε γυρίσει εν τω μεταξύ και ο Φωτόπουλος), αλλά και κάποιες πολύ ποιοτικές προσθήκες (Κολλυρόπουλος, Μόσχος, Τσαγκαλίδης, Μπαριτάκης και οι δύο Αφρικανοί, Μπα και Σαμούρα). ήρθε η δεύτερη θέση στην κατηγορία και μια ιστορική άνοδος. Μάλιστα την ίδια χρονιά, η ομάδα μπάσκετ, που είχε επανέλθει, κατακτούσε το πρωτάθλημα της Δ' Κατηγορίας ΕΣΚΑΝΑ, έχοντας μόλις μία ήττα όλη τη χρονιά. Έτσι, το 2007 γιορτάσαμε δύο ανόδους, σε μια πολύ επιτυχημένη σεζόν για τον Προφήτη. Ανάλογα επιτυχημένη ήταν και η επόμενη χρονιά. Το μπάσκετ πέτυχε δεύτερη συνεχόμενη άνοδο και επέστρεψε στη Β' Κατηγορία, έχοντας στο ρόστερ κάποιους παλιούς (Πασαγιάννης, Τσιστράκης, Αλεξόπουλος) αλλά και μερικούς από μεταγραφή (Αραμπατζόγλου, Καρασούλος), που όμως έδεσαν αμέσως με τους υπόλοιπους. Το ποδόσφαιρο στην Α' Κατηγορία, με την ίδια ουσιαστικά ομάδα στάθηκε θαυμάσια και κέρδισε με το σπαθί του την παραμονή. Όμως τα συσσωρευμένα λάθη που έγιναν την επόμενη χρονιά ήταν καταδικαστικά, και ο κύκλος έκλεισε με τον υποβιβασμο, πέφτοντας κατηγορία σχεδόν αμαχητί. Έτσι από τότε η ομάδα βρίσκεται στη Β' Κατηγορία. Το 2010 σώθηκε την τελευταία στιγμή, τις επόμενες χρονιές διεκδίκησε με πολύ σοβαρές πιθανότητες την επιστροφή στην Α' Κατηγορία, όμως πάντα έμενε έξω για λίγο. Το 2015 ήρθε εκ νέου ο υποβιβασμός στη Γ' Κατηγορία, κυρίως εξ' αιτίας εξωγενών παραγόντων (διαιτησία, επεισόδια και αφαίρεση βαθμών), σε μια χρονιά που αποδείχτηκε "στοιχειωμένη" για τον σύλλογο, που είδε και την ομάδα μπάσκετ να υποβιβάζεται στην τελευταία τοπική κατηγορία, την Δ'. Νωρίτερα, το 2010 και μετά από τρελή πορεία, (ο πρώτος γύρος έκλεισε με τον Προφήτη τρίτο απ' το τέλος) ήρθε μια αξέχαστη άνοδος στη Β'. Προπονητής ήταν ο Παύλος Κάσσης με τον οποίο η ομάδα προσπάθησε να σταθεροποιηθεί,, αλλά τα κατάφερε μόνο πρόσκαιρα, με την ομάδα να γνωρίζει δύο απανωτούς υποβιβασμούς και να πέφτει στη Δ' Κατηγορία. Ένα ακόμη πολύ σημαντικό γεγονός ήταν η επαναδραστηριοποίηση των γυναικείων τμημάτων. Η χειμερία νάρκη κράτησε δέκα χρόνια και η ομάδα επέστρεψε στα πρωταθλήματα της ΕΣΚΑΝΑ τη σεζόν 2011-12. Από τότε η γυναικεία ομάδα είναι σταθερά μέσα στις κορυφαίες της Ένωσης, με αποκορύφωμα τη σεζόν 2014-15, όταν και ο Προφήτης παρουσίασε θεωρητικά την ισχυρότερη ομάδα στην ιστορία του (και ίσως φαβορί και για την άνοδο), περιορίστηκε όμως στην τρίτη θέση, όπως είχε συμβεί και την προηγούμενη χρονιά...